Ulemperne ved mikropumper omfatter hovedsageligt følgende aspekter:
1. Begrænsninger i driftsforhold
Kan ikke køre uden vand i lang tid: mikropumpen er let at brænde i tilstanden af vandmangel, primært fordi pumpen i tomgang eller tør rotation, vil motoren og mekaniske dele blive beskadiget af manglende smøring og køling.
Utilstrækkelig selvansugende kapacitet: Nogle mikropumper har ikke selvansugende kapacitet og skal nedsænkes eller installeres under væskeniveauet for at fungere normalt, hvilket begrænser deres brugsscenarier.
For det andet ydeevne og effektivitet

Begrænset udgangstryk: Udgangstrykket (hovedet) af den mikrodykkede pumpe er normalt ikke højt, så det er mere velegnet til lejligheder med stort flow og lavt tryk.
Støjproblemer: Selvom nogle mikropumper såsom DC børsteløse pumper klarer sig godt med hensyn til støjsvaghed, er der stadig nogle produkter med store støjproblemer, især ved høj hastighed.
Vedligeholdelse og omkostninger
Høje vedligeholdelsesomkostninger: For nogle typer mikropumper, såsom børsteløse jævnstrømspumper, kan vedligeholdelsesomkostningerne være høje på grund af deres komplekse konstruktion. Derudover kan der i tilfælde af fejl være behov for professionel vedligeholdelse.
Højere omkostninger: Sammenlignet med nogle traditionelle pumper er fremstillingsomkostningerne for mikropumper højere, hvilket også fører til dens relativt høje salgspris.
4. Andre ulemper
Let at bære: For mikropumper, der bruger kulbørster til at vende, vil kulbørsterne slides med den øgede brugstid, hvilket resulterer i øget lyd eller endda svigt.
Resonansproblem: I nogle tilfælde kan mikropumpens motorvibrationsfrekvens være den samme eller tæt på vibrationsfrekvensen for rammen eller omgivende plastdele, hvilket resulterer i forekomsten af resonansfænomener.

